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Poster communications

Identification in vivo des ADN cibles de facteurs de transcription impliqués dans la formation du bois de tension

Résumé : Lorsqu’un arbre feuillu est incliné en raison d’une contrainte gravitationnelle ou mécanique (vent, sol en pente), il met en place sur la partie supérieure des tiges inclinées, un bois de réaction, appelé bois de tension permettant aux tiges de retrouver une position d’équilibre (bien souvent verticale). Au niveau anatomique, le bois de tension se caractérise par la présence de fibres particulières aux parois très épaisses, appelées fibres G. La paroi des fibres G présente une couche surnuméraire, pauvre en lignines, très riche en cellulose dont les microfibrilles sont orientées quasi parallèlement à l’axe de la fibre. Le bois de tension représente un bon système biologique pour décrypter certains mécanismes importants de la formation du bois. Les facteurs de transcription (FT) jouent un rôle central dans la régulation de ces mécanismes. L’objectif de ces travaux est d’identifier les séquences d’ADN cibles de certains FT choisis (Myb1, Myb21, VND7), potentiellement importants pour la formation du bois. Pour cela, la technique ChIP-SEQ (Immunoprécipitation de chromatine suivie par un séquençage à très haut-débit) a été développée afin d’identifier in vivo ces ADN cibles. Cette technique, bien que souvent employée en biologie animal [1] [2], est encore peu utilisée en biologie végétal. Suite à la ChIP, une analyse qPCR permet de mesurer l’enrichissement des cibles connues afin de vérifier l’efficacité de l’immunoprécipitation, avant de séquencer les échantillons. Actuellement les premiers essais de ChIP, analysés en qPCR, ont permis de valider la méthode, et ont mis en évidence l’enrichissement en un promoteur cible connu pour un des FT choisis. L’avancée des résultats sera présentée lors du congrès.
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Poster communications
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https://hal.inrae.fr/hal-02745476
Contributor : Migration Prodinra Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Wednesday, June 3, 2020 - 8:46:10 AM
Last modification on : Tuesday, October 12, 2021 - 5:20:21 PM
Long-term archiving on: : Thursday, December 3, 2020 - 2:38:34 AM

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RFP Lille 2011_1.pdf
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  • HAL Id : hal-02745476, version 1
  • PRODINRA : 354622

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Pascale Ferrigno, Nathalie Boizot, Wassim Lakhal, Marie-Claude Lesage Descauses, Jean-Charles Leplé, et al.. Identification in vivo des ADN cibles de facteurs de transcription impliqués dans la formation du bois de tension. Journées du Réseau Français des Parois, Jun 2011, Villeneuve d’Ascq, France. 2011, Journées du Réseau Français des Parois. Programme et Résumés. ⟨hal-02745476⟩

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