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Conference papers

Inventaire des bactéries caecales du lapin par clonage aléatoire : résultats et perspectives

Résumé : Les récents progrès en biologie moléculaire nous permettent maintenant de caractériser (identification des espèces bactériennes) des écosystèmes digestif complexes de manière plus exhaustive. Nous avons réalisé un inventaire moléculaire, basé sur l'analyse des séquences d'ADNr 16S, sur un prélèvement de caecum d'un lapin adulte. Une banque aléatoire de 228 clones a été constituée. De l'analyse de ces séquences, 70 OTU (operational taxonomic unit) ont été identifiés dont 60 (80%) correspondent à de nouvelles espèces bactériennes. L'analyse phylogénétique de ces OTU les range dans leur très grande majorité (92,9%) dans les Firmicutes ainsi que quelques Bacteroidetes (4,3%) et Verrucomicrobiae (1,4%). On constate peu de redondance avec un précédent inventaire, plus restreint et réalisé sur de jeunes lapins. Cette étude met en évidence le caractère particulier de la flore caecale du lapin et une grande biodiversité.
Mots-clés : BIOLOGIE MOLECULAIRE
Document type :
Conference papers
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https://hal.inrae.fr/hal-02752881
Contributor : Migration Prodinra <>
Submitted on : Wednesday, June 3, 2020 - 7:04:03 PM
Last modification on : Friday, June 4, 2021 - 2:40:10 PM

Identifiers

  • HAL Id : hal-02752881, version 1
  • PRODINRA : 10002

Citation

Laurent Cauquil, Valérie Monteils, Jean-Jacques Godon, Geraldine Mastin, Sylvie Combes, et al.. Inventaire des bactéries caecales du lapin par clonage aléatoire : résultats et perspectives. 12. Journées de la Recherche Cunicole, Nov 2007, Le Mans, France. ⟨hal-02752881⟩

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