Caractérisation des déterminants génétiques et moléculaires de la résistance à Aternaria dauci chez la carotte
Résumé
La brûlure due à Alternaria dauci, est la maladie foliaire la plus préjudiciable sur carotte, qu'il s'agisse de production de racines ou de semences. Développer des variétés présentant un niveau de résistance fort et durable est l'un des objectifs principaux des sélectionneurs de l'espèce. Le présent travail a permis d'y contribuer en caractérisant les facteurs de résistance impliqués. Deux familles d'individus en ségrégation pour ce caractère ont fait l'objet, d'une part, d'un phénotypage sur descendance F3 en tunnel (contamination artificielle) et au champ (infestation naturelle) et, d'autre part, d'un géntypage grâce à des marqueurs AFLP, ISSR, APF-RGA. Les deux cartes génétiques obtenues (1367.6cM et 1570.2cM) ont un espacement moyen des marqueurs de 7.5 cM. Le logiciel QTLCartographer, a permis de détecter un total de 16 QTL significatifs dont deux expliquent 17 et 24% de la variation phénotypique totale. Parmi ceux-ci, 10 ont été détectés pour la 1ère date de notation. La phase de l'installation de la maladie pourrait donc être la plus discriminante pour la sélection phénotypique. Au contraire, les QTL détectés pour les 2ème et 3ème dates de notation, généralement avec un R2 plus faible que pour ceux de la 1ère date, pourraient être impliqués dans la limitation de l'invasion de l'hôte par le pathogène ou dans le phénomène de régénération du feuillage. par ailleurs, une nouvelle procédure d'évaluation de la résistance basée sur un test plante entière est proposée. Enfin, les résultats ont mis en évidence la complémentarité de plusieurs approches moléculaires pour augmenter la saturation génétique chez la carotte