Le champignon Diplocarpon rosae est l'agent causal de la maladie des taches noires du rosier qui touche une grande proportion de rosiers de jardin. Dans cette étude, une collection de 77 souches monoconidiales du champignon, issues de rosiers cultivés (50 souches prélevées en Europe et en Asie) et de rosiers sauvages (27 souches prélevées au Kazakhstan) a été établie. Deux souches de D. rosae ont été séquencées par la technique Illumina®, et l'analyse comparative des séquences génomiques de ces deux souches a permis de développer 27 marqueurs microsatellites. L'analyse moléculaire des 77 souches a révélé une forte différenciation génétique entre les souches provenant du compartiment cultivé et celles provenant du compartiment sauvage. Un test de pathogénicité en conditions contrôlées (serres) a permis de définir le niveau d'agressivité de 10 souches fongiques d'origine française sur 19 cultivars de rosiers. Ce test a ensuite été appliqué pour définir le niveau de résistance/sensibilité de nouvelles variétés de rosier non commercialisées vis-à-vis de ces 10 souches fongiques. Une bonne corrélation entre le test en conditions contrôlées et les notes obtenues en plein champ permet d'envisager ce test pour une caractérisation rapide et fiable du niveau de résistance de nouvelles variétés de rosier.