PHIS (Phenotyping Hybrid Information System) - Laboratoire d'Ecophysiologie des Plantes sous Stress Environnementaux
Logiciel Année : 2024

PHIS (Phenotyping Hybrid Information System)

Résumé

PHIS is an ontology-driven Information System designed for Plant Phenomics, based on OpenSILEX. PHIS is designed to store, organize and manage highly heterogeneous (e.g. images, spectra, growth curves) and multi-spatial and temporal scale data (leaf to canopy level) originating from multiple sources (field, greenhouse). Its ontology-driven architecture is a powerful tool for integrating and managing data from multiple experiments and platforms including field and greenhouse. PHIS allows to enrich datasets with knowledge and metadata enabling the reuse of data and meta-analyses. It interoperates and integrates data into external resources (e.g. modelling platforms, external databases and analysis pipelines) and provides FAIR data.
PHIS est un système d'information piloté par des ontologies, basé sur OpenSILEX et conçu gérer les données de phénotypage haut-débit. PHIS est conçu pour stocker, organiser et gérer des données très hétérogènes (images, spectres, courbes de croissance, par exemple) et à plusieurs échelles spatiales et temporelles (de la feuille à la canopée) provenant de sources multiples (champ, serre). Son architecture basée sur une ontologie est un outil puissant pour l'intégration et la gestion de données provenant d'expériences et de plateformes multiples, y compris sur le terrain et en serre. PHIS permet d'enrichir les ensembles de données avec des connaissances et des métadonnées permettant la réutilisation des données et des méta-analyses. Il interopère et intègre les données dans des ressources externes (par exemple des plateformes de modélisation, des bases de données externes et des pipelines d'analyse) et fournit des données FAIR.

Dates et versions

hal-04784056 , version 1 (14-11-2024)

Identifiants

  • HAL Id : hal-04784056 , version 1

Citer

Neveu Pascal, Anne Tireau, Isabelle Alic, Arnaud Charleroy, Llorenç Cabrera-Bosquet. PHIS (Phenotyping Hybrid Information System). 2024. ⟨hal-04784056⟩
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