Un estuaire est un écotone. Il assure des fonctions écologiques diverses pour les espèces piscicoles qui le fréquentent. Chaque estuaire possède ses caractéristiques géographiques, démographiques, hydrauliques, sédimentologiques et biologiques propres. Ces spécificités influencent la composition et la structure de l'ichtyofaune qui fréquente le milieu. La Gironde est le plus grand estuaire français et un des plus grands d'Europe. Il est souvent présenté comme l'un des plus préservés. Ce travail a pour but de représenter un premier document de référence sur son état écologique actuel à travers la composition spécifique de son cortège ichtyologique. Une liste faunistique est établie sur la base des données issues des deux protocoles d'échantillonnage scientifique différents et complémentaires qui sont régulièrement mis en oeuvre depuis de nombreuses années. Une typologie du peuplement est ainsi réalisée suivant différents critères écologiques. On aborde ainsi l'utilisation de l'estuaire par les populations ichtyologiques. La Gironde est notamment caractérisée par une proportion relativement faible d'espèces effectuant l'ensemble de leur cycle en estuaire par rapport au nombre d'espèces migratrices essentiellement d'origine marine. En particulier, elle apparaît comme l'estuaire d'Europe de l'ouest avec le plus grand cortège de migrateurs amphihalins. En reprenant un travail effectué par Elliott et Dewailly (1995), on compare la typologie du peuplement girondin à celles de 17 autres estuaires européens. La classification effectuée soulève un certain nombre de questions concernant la particularité des milieux estuariens pour ce type de diagnostics comparatifs. Ils nécessitent une intercalibration des protocoles d'échantillonnage, une prise en compte de la dimension physique du milieu (marnage, limite amont de l'intrusion saline), du degré d'anthropisation et de son évolution.