Dans les régions d'élevage intensif, notamment d'élevage porcin, la pollution des ressources aquatiques et la réglementation ont contraint les exploitations à se doter de stations de traitement des lisiers de porcs afin d'éliminer une partie de l'azote par voie biologique. Dans l'objectif de fiabiliser et d'améliorer la gestion et le dimensionnement de ces stations à l'aide de la simulation, un modèle de prédiction des caractéristiques initiales du lisier (LisPorc1) a été développé et couplé avec un modèle de transformation de la matière organique et de l'azote au cours du traitement biologique (PiWaT1). A partir de ces deux modèles, les simulations effectuées ont permis d'étudier les différentes stratégies de traitement ainsi que les principales pistes pour le contrôle et la régulation de ces stations. La détection de la fin de la dénitrification pendant les phases d'anoxie et la détection de la fin de la nitritation pendant la phase d'aération sont les principales voies d'optimisation du traitement. Le potentiel oxydo-réducteur et le pH semblent particulièrement bien adaptés pour le contrôle de ces processus.