Les diatomées sont des bio-indicateurs très étudiées de l’état de la qualité des eaux, qui dominent généralement la biomasse algale du biofilm (ou périphyton) de rivière. De par leur composition spécifique, leur morphologie, leur locomotion ou leur vitesse de déplacement, elles permettent de diagnostiquer la présence de toxiques (métaux lourds, pesticides, médicaments…). Par exemple, les diatomées peuvent se déformer en présence de métaux lourds tels le Cadmium, le Zinc ou le Cuivre. Elles sont fortement influencées par l’acidité de l’eau, la présence de nutriments (particulièrement l’azote et le phosphore), de matière organique, une faible oxygénation des eaux ou une très forte intensité lumineuse. En tant que producteur primaire, elles se trouvent affectées de manière directe par les facteurs physiques et chimiques de l’eau. Leur frustule en silice facilite leur conservation et leur identification. De plus l’échantillonnage est peu coûteux et simple. Soizic Morin, chargée de recherche en écotoxicologie sur le thème de l’impact des contaminants toxiques (métaux, pesticides, médicaments) retrouvés dans les cours d’eau (urbains, industriels, agricoles) au niveau du biofilm algal (biomasse, répartition spatiale et spécifique, physiologie, photosynthèse), s’est posée la question des effets indirects des contaminants sur la communauté algale pouvant résulter des interactions entre les organismes au sein du biofilm (protozoaires, petits métazoaires). Jacky Vedrenne référent national sur la thématique des protozoaires et métazoaires des boues de station d’épuration, fin 2013, a rejoint Soizic dans ce projet de recherche innovant. Cette étude est menée dans le but de quantifier dans un premier temps les biais qui pourraient être dus au broutage des micro-organismes, puis analyser l’évolution des impacts des polluants sur le réseau trophique du biofilm et observer leur impact indirect sur les producteurs primaires via les consommateurs. Au préalable, afin d’estimer l’impact des protozoaires au sein des biofilms, un premier comptage a été effectué par Jacky Vedrenne sur les échantillons provenant de l’amont et de l’aval du ruisseau de Bourg et de la rivière de Leyre et transcrit sous forme de diagrammes. On remarque que les diatomées et les protozoaires sont co-dominants dans ces deux milieux. La part que représente les interactions entre ces organismes, comme le broutage, peuvent être non-négligeable et suscite l’intérêt quant à la diffusion des toxiques au niveau de cet écosystème aquatique.