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Communication dans un congrès

Le métabarcoding dans les suivis de diversité des coléoptères saproxyliques – outil taxinomique et identifications automatiques

Résumé : Les résultats du projet Passifor illustrent successivement deux avancées. La première concerne la construction de la bibliothèque des barcodes des coléoptères saproxyliques de France métropolitaine. Son degré de complétude est présenté, et son emploi dans la taxinomie intégrative des coléoptères saproxyliques est discuté, en particulier dans les cas de forte variabilité génétique intraspécifique (confusions morphologiques, diversité cryptique, etc.) ou de faible distance génétique inter-spécifique (validité des espèces…). La seconde aborde le taux de détection et de contamination et la valeur-ajoutée du métabarcoding NGS sur les soupes d’ADN multi-spécifiques issues de piégeage des coléoptères saproxyliques.
Type de document :
Communication dans un congrès
Liste complète des métadonnées

https://hal.inrae.fr/hal-02604900
Déposant : Migration Irstea Publications <>
Soumis le : samedi 16 mai 2020 - 10:07:58
Dernière modification le : mardi 15 septembre 2020 - 16:22:06

Identifiants

  • HAL Id : hal-02604900, version 1
  • IRSTEA : PUB00051184

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Citation

Christophe Bouget, S. Shokrala, M. Hajibabaei, B. Nusillard, Rodolphe Rougerie, et al.. Le métabarcoding dans les suivis de diversité des coléoptères saproxyliques – outil taxinomique et identifications automatiques. Réunion biennale du réseau naturaliste « entomologie » de l’ONF, Oct 2016, Condat, France. pp.42. ⟨hal-02604900⟩

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