DNA metabarcoding in biodiversity monitoring - a case study on French saproxylic beetles
Le métabarcoding dans les suivis de diversité des coléoptères saproxyliques – outil taxinomique et identifications automatiques
Résumé
Les résultats du projet Passifor illustrent successivement deux avancées. La première concerne la construction de la bibliothèque des barcodes des coléoptères saproxyliques de France métropolitaine. Son degré de complétude est présenté, et son emploi dans la taxinomie intégrative des coléoptères saproxyliques est discuté, en particulier dans les cas de forte variabilité génétique intraspécifique (confusions morphologiques, diversité cryptique, etc.) ou de faible distance génétique inter-spécifique (validité des espèces…). La seconde aborde le taux de détection et de contamination et la valeur-ajoutée du métabarcoding NGS sur les soupes d’ADN multi-spécifiques issues de piégeage des coléoptères saproxyliques.