Les travaux qui ont été réalisés dans le cadre du programme Aquaref sur les prélèvements de sédiments et les risques de contamination des échantillons sont synthétisés. Un besoin d'harmonisation des pratiques de prélèvement et de prétraitement des sédiments a été mis en évidence suite à un essai d'intercomparaison sur le terrain. Des recommandations sont formalisées dans des guides Aquaref régulièrement mis à jour. Des recommandations sont émises : la nécessité de bien s’approprier le site de prélèvement pour localiser les dépôts fins (échantillon plus homogène) ; l'importance de la maîtrise du prélèvement - nettoyage et rinçage adapté de tout le matériel utilisé (échantillonnage, prélèvement, conditionnement) ; l'utilisation de matériel de prélèvement et de conditionnement adapté ; le suivi et la bancarisation des paramètres normalisateurs.