Le bassin versant Gironde-Garonne-Dordogne est un lieu de passage obligatoire pour l’ichtyofaune migratrice, qui se compose d’un cortège d’espèces migratrices dont font partie deux espèces d’aloses, l’alose feinte (Alosa fallax) et la grande alose (Alosa alosa)(Béguer, Beaulaton et al. 2007). Ces deux espèces sont parmi les plus exigeantes en terme d’oxygénation des eaux dans l’estuaire (Maes, Stevens et al. 2007, Taverny, Elie et al. 2009). La population de grande alose subit un fort déclin depuis le début des années 2000, conduisant à un moratoire sur les pêches en 2008. Les conditions de ce déclin sont encore incertaines mais l’analyse de l’évolution du stock reproducteur et de l’abondance des juvéniles d’alose dans l’estuaire montre une distorsion pour les années 2001 à 2005 : le niveau de recrutement est en chute malgré un stock reproducteur stable à un niveau élevé (environ 150 000 individus). De l’incubation jusqu’à l’arrivée dans l’estuaire, les alosons sont très exposés aux modifications du milieu, notamment en termes de température et d’oxygène dissous, ces deux paramètres pouvant avoir un effet négatif sur la survie des juvéniles d’alose. De plus, les alosons doivent traverser au cours de leur dévalaison vers l’estuaire, une zone fortement turbide située aux alentours de Bordeaux: le bouchon vaseux. Les réactions biogéochimiques ainsi que l’activité micobienne au sein du bouchon vaseux, peuvent ainsi provoquer de sévères chutes du taux d’oxygène dissous dans l’eau. Ainsi les alosons sont potentiellement soumis à de mauvaises conditions d’oxygénation (hypoxie) lors de leur dévalaison qui survient en général entre la mi- août et la mi-octobre. Dans le contexte d’une population de grandes aloses en difficulté sur le bassin versant Gironde Garonne Dordogne, la question est de savoir si le franchissement de cette zone hypoxique est susceptible de générer une mortalité chez les alosons, de quantifier cette mortalité ajoutée et d’estimer les conséquences sur la force des cohortes et plus largement de voir l’impact des hypoxie sur leur comportement. Dans un second temps nous avons cherché à quantifier ces évènements hypoxiques et à identifier les conditions d’apparition de ces événements au vue des résultats obtenus sur les alosons.