Dans le cadre des préconisations de la DCE sur la confiance de l'évaluation de l'état écologique des cours d'eau, l'Irstea est impliqué dans les actions Aquaref pour définir et évaluer les sources d'incertitudes liées aux méthodes hydrobiologiques. Cette présentation met en avant les principaux résultats pour le protocole d'acquisition de la donnée pour la méthode «macrophytes en cours d'eau ». Une approche systémique a dans un premier temps été utilisée, en étudiant la variabilité liée à l'opérateur, la variabilité spatiale liée au positionnement du point de prélèvement et la variabilité temporelle liée à la date du relevé IBMR. Dans un deuxième temps, une approche par modélisation a été employée pour évaluer l'impact des erreurs de détermination taxonomique sur la note IBMR. Un modèle de probabilité d'appartenance à une classe écologique a ensuite été construit en y intégrant toutes les sources d'incertitudes autour de l'indicateur. Cette étude permettra d'apporter des points d'amélioration de la chaîne d'acquisition de données et de l'évaluation et d'intégrer ce processus dans les règles d'évaluation.