Les mousses biologiques stables se retrouvent en surface de nombreux bassins de stations d'épuration à boues activées (une sur cinq en France). L'abondance de ces flottants crée des sujétions d'exploitation (contraintes d'évacuation) et peut aussi altérer la qualité du rejet en cas de déversement intempestif avec l'eau épurée. Après une typologie des différents types de mousses, l'article définit les mousses biologiques en s'appuyant sur l'identification des germes filamenteux. Les solutions passent par la maîtrise de la croissance filamenteuse. Dans les cas de crises aiguës ou transitoires, on peut intervenir de façon radicale et rapide en procédant à une chloration des mousses. C'est une technique efficace lorsqu'elle est bien conduite. Un travail de fond, basé sur une bonne connaissance de la station, sur un suivi régulier des paramètres de fonctionnement et des conditions d'alimentation de la station, gage bien souvent la réussite de la stratégie appliquée. De plus, l'étude des relations filaments-milieu environnant a permis de dégager une solution intéressante (la zone de contact) pour le traitement de certains filaments.