La mise en place de la Directive Cadre sur l'Eau a initié le développement d'indicateurs d'état écologique des plans d'eau, dont l'indice phytoplancton lacustre (IPLAC) et l'indice biologique macrophytique en lac (IBML). Cette Directive prévoyait également le développement d'un indicateur basé conjointement sur les macrophytes et le phytobenthos. La France, ne disposant pas à l'époque d'un tel indice, avait comme la majorité des autres états membres participé au premier round d'intercalibration avec un indice historiquement dédié aux cours d'eau (IBD). Depuis, la majorité des pays européens ont développé de nouvelles méthodes, mais prenant en compte de façon distincte phytobenthos et macrophytes, et considérant de plus les diatomées comme un proxy du phytobenthos. Il s'agit donc aujourd'hui de développer un indice diatomique dédié aux milieux lacustres. Pour se faire, une campagne exceptionnelle d'acquisition des données s'est déroulée entre 2015 et 2017 sur l'ensemble du territoire métropolitain avec l'aide des Agences de l'Eau et des DREAL. Le présent rapport, après un point sur les données reçues et exploitables, a pour objectif principal de présenter les travaux de développement d'un indice dédié à l'évaluation de l'état écologique des plans d'eau à l'échelle du territoire national. Il est important de souligner les limites de l'indice proposé, assis sur un jeu de données trop limité, appelant à une révision lorsque davantage de données seront disponibles.