L'indice diatomique antillais (IDA) est un outil de bioindication, destiné à l'évaluation de la qualité biologique des cours d'eau des Antilles françaises à partir de la structure de la communauté des diatomées benthiques. Cet outil a été développé conjointement par Asconit et Irstea, dans le cadre d'un programme de recherche-et développement sous la maîtrise d'Ouvrage des Offices de l'Eau de Guadeloupe et de Martinique, avec la participation des Directions de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement (DEAL) de Guadeloupe et de Martinique, et avec le soutien technique et financier de l'Agence Française pour la Biodiversité (AFB), afin de doter les Antilles d'un outil « DCE-compatible » disponible pour le 2e plan de gestion DCE (2016-2021 ; European Commission 2000, MTES 2018 a & b). Réglementairement, l'usage de l'IDA est limité au suivi du réseau de contrôle et de surveillance (RCS). Le présent guide a pour objet de cadrer la mise en oeuvre opérationnelle de l'IDA afin d'obtenir les résultats d'évaluation les plus fiables possible. A chaque étape de l'acquisition des données de surveillance, il convient de respecter le protocole de mise en oeuvre de l'indice de la phase de terrain jusqu'au calcul de la note ou EQR, notamment lors de la conception du plan d'échantillonnage, de sa mise en oeuvre, du traitement des échantillons récoltés, de la détermination des espèces et du comptage des unités diatomiques, ainsi que du calcul des notes indicielles à partir des inventaires spécifiques. Des incertitudes peuvent être générées à chaque niveau de mise en oeuvre du protocole. Aussi, cet ouvrage a pour but de décrire précisément chacune des étapes-clés de la démarche, afin que la mise en oeuvre de l'indice soit la plus rigoureuse et reproductible possible. Le présent guide ne saurait se substituer à une formation adaptée d'opérateurs qualifiés.