La présente communication vise à présenter les démarches et les résultats de l'étude des pollutions à pesticides agricoles et leurs effets sur les cours d'eau des Coteaux de Gascogne, dans le cadre du programme partenarial inter-régional IMAQUE mené au cours des années 2005 et 2006, sous l'égide du GIS ECOBAG. Elle présente tout d'abord le dispositif de stations et les campagnes de suivi de terrain réalisées, en lien avec les principales époques d'épandage saisonnier de pesticides sur les bassins versants. Un programme d'étude des effets écotoxicologiques des pesticides sur les biofilms diatomiques a ensuite été réalisé en conditions contrôlées de hall technique, associé au suivi intégré des concentrations de pesticides réellement présents dans les eaux d'exposition, via l'immersion de capteurs passifs POCIS. Une liaison entre exposition et effets a été nettement observée avec différentes molécules herbicides utilisées sur les Coteaux de Gascogne (familles des triazines, des urées substituées, des chloroacétanilides), notamment au niveau de paramètres globaux représentatifs de la croissance des biofilms algaux (quantité de Chl.a, matière sèche, MSSC). Il sera utile de continuer l'exploitation des résultats, qui n'est pas encore complètement achevée, puis de mettre en place des démarches expérimentales plus approfondies, afin : 1) de repérer des listes d'espèces sensibles ou résistantes utilisables ensuite en bio-indication ; 2) de repérer les mécanismes plus fins mis en jeu dans les effets toxiques, en fonction des types de molécules phytosanitaires rencontrées et de leurs modes d'action spécifiques.