Project Meeting / Activity Group 3 Diatoms - Analysis of the French diatom dataset for Rebecca issues: Effects of the natural variation and of nutrients causing eutrophication on the diatom communities
Réunion de projet / Groupe d'activités 3 Diatomées - Analyse du jeu de données français sur les diatomées au service de Rebecca : Effets de la variation naturelle et des nutriments responsables de l'eutrophisation sur les communautés de diatomées
Résumé
This meeting organized by the University of Bratislava is a coupled Rebecca / WP4 Meeting and WP4 / GIG co-ordinators joint meeting. The scientific talks about step results are presented to all activity groups, in order: 1) to make a good link between the different WGs of the project ; 2) to allow a true exchange of knowledge between activity groups, with discussions on both specific and generic issues ; and 3) to make the link between the FP6 project and the coordinators of Geographical Intercalibration Groups. The present t alk, given by Cemagref, makes the point of the work done on the diatom compartment from the beginning of the project, based on the analyses of French national dataset. The first point concerns the investigation of biotypology. 11 different biotypes have been identified, 5 of them being driven by different natural abiotic conditions(i.e. 5 reference biotypes) and 6 other biotypes being mainly structured under influence of different kind and intensities of anthopogenic alteration. Another focus concerned the reduction of species number aiming at a simplification of national datasets without loosing structuring ecological information. With the help of a structuring index set-up by our research team (the GSI), it was possible to reduce the number of species to 1/3 of the total (from 941 to 353) without loosing ecological structuring information. Then was presented the progress of the WFD implementation under French conditions. 234 true reference sites have been selected, divided into 5 natural biotypes. This natural framework has been then used to set-up a national assessment system using BDI. Assessment grids have been built by natural region (key values for quality class limits by HER, EQR calculations on the basis of the convenient reference level per homogenous natural zone). The last part of the talk concerned a very hard point, knowing the taxonomic harmonization work carried out by Michel Coste on a regroument of 4 national diatom datasets, and the coding of a common diatom abbreviation list under an Omnidia standard, allowing to make joint and homogenous analyses of the 4 national datasets (work just finished). Such regrouped analyses will begin in the next weeks.
Ce meeting organisé par l'Université de Bratislava est une réunion conjointe Rebecca / WP4 et WP4 / GIG. Les discussions scientifiques sur les résultats d'étape sont présentées à tous les groupes d'activités, afin : 1) d'établir un bon lien entre les différents groupes de travail du projet; 2) de permettre un véritable échange de connaissances entre les groupes d'activités, avec des discussions sur des questions spécifiques et génériques; et 3) de faire le lien entre le projet de recherche 6ème PCRD et les coordinateurs des groupes d'intercalibration géographique de l'UE. Le présent exposé oral, donné par le Cemagref, fait le point du travail effectué sur le compartiment diatomée depuis le début du projet, basé sur les analyses du jeu de données national français. Le premier aspect concerne l'investigation de la biotypologie. 11 biotypes différents ont été identifiés, 5 d'entre eux étant sous influence de différentes conditions abiotiques naturelles (soit 5 biotypes de référence) ; 6 autres biotypes étant principalement structurés sous l'influence de différentes catégories et intensités d'altérations anthopiques. Un autre objectif visait à la réduction du nombre d'espèces, le but étant de simplifier les jeux de données nationaux sans perdre d'informations écologiques structurantes. Grâce à un indice de structuration mis en place par notre équipe de recherche (le GSI), il a été possible de réduire le nombre d'espèces à 1/3 du total (de 941 à 353) sans perdre d'information écologique.structurante. L'état d'avancement de la mise en oeuvre de la DCE dans les conditions françaises a ensuite été présenté. 234 sites de référence vraie ont été sélectionnés, répartis entre 5 biotypes naturels. Ce cadre naturel a ensuite été utilisé pour mettre en place un système national d'évaluation utilisant l'IBD. Des grilles d'évaluation ont été construites par région naturelle (valeurs clés pour les limites de classe de qualité par HER, calculs d'EQR sur la base du niveau de référence adéquat par zone naturelle homogène). La dernière partie de la communication a porté sur un point très difficile, à savoir le travail d'harmonisation taxonomique effectué par Michel Coste sur un re-regroupement de 4 jeux de données nationaux sur les diatomées, et le codage d'une liste d'abréviations de diatomées sous un standard commun Omnidia, permettant de réaliser des analyses homogènes des 4 jeux de données nationaux (travaux tout juste terminés). Ces analyses regroupées débuteront dans les prochaines semaines.