Molecular identification of Trichinella species by multiplex PCR: new insight for Trichinella murrelli
Identification moléculaire des espèces de Trichinella par PCR multiplex : nouvel éclairage pour Trichinella murrelli
Résumé
In order to identify Trichinella at the species level, the commonly used test is a multiplex PCR, allowing the discrimination of nine out of the twelve taxa described so far. This test is based on five primer pairs amplifying fragments of the large subunit rDNA. Each taxon produces one or two bands of different sizes, resulting in a specific band pattern. By multiplex PCR, Trichinella murrelli shows two bands of 127 bp and 316 bp. However, a third band of 256 bp can occur. This band can lead to misidentification, since it is similar to the 253 bp band displayed by Trichinella britovi. BLAST analysis confirmed that the 256 bp band is from T. murrelli. The aim of this short note is to inform analysts that T. murrelli larvae may display either two-or three-band patterns.
Afin d’identifier les Trichinella au niveau de l’espèce, le test couramment utilisé est une PCR multiplex, permettant la discrimination de neuf des douze taxons décrits jusqu’à présent. Ce test est basé sur cinq paires d’amorces amplifiant des fragments de la grande sous-unité l’ADN ribosomal. Chaque taxon produit une ou deux bandes de tailles différentes, résultant en un patron de bandes spécifique. Par PCR multiplex, Trichinella murrelli présente deux bandes de 127 pb et 316 pb. Cependant, une troisième bande de 256 pb peut s’observer. Cette bande peut être la cause d’une erreur d’identification, car elle est similaire à la bande de 253 pb affichée par Trichinella britovi. L’analyse BLAST a confirmé que la bande à 256 pb provient de T. murrelli. Le but de cette note est d’informer les analystes que les larves de T. murrelli peuvent présenter des patrons à deux ou trois bandes.
Domaines
Zoologie des invertébrés
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
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