Une maladie inconnue de la betterave sucrière est apparue en Côte d'Or au début des années 1990 et a gagné le reste du bassin sucrier du Centre-est (Bourgogne et Jura). Les programmes d'étude financés par la filière betterave-sucre et Conseil régional de Bourgogne de 1997 à 2007, ont permis d'en élucider entièrement l'étiologie et la transmission, de développer des méthodes de diagnostic moléculaire, et de parvenir à une compréhension globale de son épidémiologie. Les méthodes de lutte directes et agronomiques préconisées ont montré leur efficacité pour limiter les pertes de rendement en sucre associées à cette maladie. Par ailleurs, la biologie de bactéries pathogènes habitant le phloème des plantes, encore peu connues, a été étudiée dans leurs relations complexes avec leur insecte vecteur, permettant des hypothèses sur les mécanismes d'émergence de ce type de nouvelles maladies des plantes.