Bien que la nocivité des nitrates pour la santé soit controversée, la légitimité d’une régulation de la pollution azotée n’est pas remise en cause. En effet, celle-ci ne concerne pas que l’eau de boisson. L’azote en excès, lorsqu’il est combiné avec les matières nutritives phosphorées, est à l’origine de l’eutrophisation des eaux superficielles qui menace le développement des activités touristiques basées sur le potentiel des milieux aquatiques. Or, l’agriculture est à l’origine presque exclusive du déséquilibre en matières azotées et matières phosphorées.