Les interdépendances hors marchés mobilisent de plus en plus les réflexions des économistes, mais aussi des politiques. Elles posent des problèmes théoriques très complexes, spécialement en agriculture, qu'il est important de bien maîtriser avant de mettre en œuvre des politiques correctives toujours très coûteuses en terme d'information et d’administration. Confrontée à cette question, l’analyse économique s’est fortement mobilisée soit par l’application de l’analyse microéconomique standard ("l’Economie de l’environnement"), soit par la recherche des méthodes et des outils originaux basés sur les préférences révélées des agents ("l’Ecole de Londres") ou par l’intégration des problématiques et des outils provenant d’autres disciplines notamment des sciences de la nature ("l’Economie Ecologique"). Cet article a pour objectif d’exposer la manière dont ces approches se sont développées et quels sont leurs apports et leurs limites en matière d’analyse comme en matière d’application possible à la politique agricole et ses instruments, et d’introduire une méthodologie plus spécifique celle du couplage des modèles agro-économiques, particulièrement adaptée à l'évolution actuelles des politiques agricoles, comme par exemple, la PAC avec les mesures agri-environnementales et l'éco-conditionnalité.