A comparative study of randomly amplified polymorphic DNA analysis and conventional phage typing for epidemiological studies of Listeria monocytogenes isolates
Comparison de deux méthodes de caractérisation de souches pour les études épidémiologiques de Listeria monocytogenes : analyse de profils RAPD et analyse de spectres de sensibilité à des bactériophages
Résumé
The analysis of RAPD profiles generated by PCR with a single 10-mer, HLWL74, was compared to bacteriophage susceptibility data for epidemiological typing of Listeria monocytogenes strains. A total of 104 L. monocytogenes strains was screened, all from serogroup 1 or serotype 4b. Of these, 53 had been isolated during 6 different listeriosis outbreaks. The remaining 51 strains were chosen randomly from our collection. A total of 38 RAPD types were observed, although each epidemic group of strains isolated during one of these outbreaks displayed a specific RAPD profile. For 98% of the strains isolated during outbreaks, the correlation between RAPD typing and phage typing was complete. Only one strain, typed as epidemic by phage typing, was clearly distinguishable from the others by RAPD analysis. Among the 51 strains not related to an outbreak, 12 were linked to epidemic groups by RAPD analysis. Two of these rearrangements were supported by phage typing. The remaining 10 strains could be excluded by phage typing from any of the epidermic groups studies. Considering all 104 isolates, the decision to relate a strain to a particular epidemic group or to exclude a strain from any epidemic group was the same for 92 isolates, using either phage typing or RAPD analysis. The RAPD analysis, which is quick, simple and suited for automation, is proposed as an attractive alternative for phage typing in epidemiological studies of listeriosis.
L'analyse de profils RAPD obtenus par PCR avec une amorce de séquence arbitraire (HLWL74) a été comparée à l'étude de spectres de sensibilité à 34 bactériophages pour le typage épidémiologique de souches de Listeria monocytogenes. Cent quatre souches appartenant toutes au sérogroupe 1 ou au sérotype 4b ont été étudiées. Parmi ces souches, 53 avaient été isolées durant 6 épidémies connues de listériose et 51 n'étaient pas des souches isolées lors d'épisodes épidémiques. La décision de rattacher une souche à un groupe épidémique particulier ou de ne rattacher une souche à aucun des 6 groupes épidémiques étudiés a été la même, quelle que soit la méthode employée, pour 92 des 104 isolats. Pour les souches isolées lors d'épidémies, les résultats des deux méthodes ont conduit aux mêmes conclusions pour 52 des 53 isolats. L'analyse des profils RAPD obtenus avec l'amore HLWL74 est proposée comme une alternative à la lysotypic pour une première approche rapide et simple lors d'études épidémiologiques de listériose.