Recherche de facteurs de transcription impliqués dans la différenciation des fibres G du bois de tension chez le peuplier - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2004

Recherche de facteurs de transcription impliqués dans la différenciation des fibres G du bois de tension chez le peuplier

Résumé

Lorsqu'un arbre se trouve, suite à une contrainte environnementale, dans une position inclinée par rapport à la verticale, celui-ci réagit et se redresse en formant du bois de réaction. Ce bois, appelé bois de tension chez les angiospermes, est situé sur la partie supérieure des tiges inclinées. Il se caractérise par la présence de fibres particulières à parois très épaisses appelées fibres G et sa formation résulte en partie de l'expression différentielle d'un set de gènes. L'objectif de ce travail consiste en l'identification de facteurs de transcription impliqués dans la différentiation des fibres G du bois de tension. Parmi les 10 000 clones des banques ESTs de bois de peuplier du projet Lignome (Déjardin et al, 2004), des homologues de facteurs ou cofacteurs de transcription ont été recherchés par alignement de séquences avec les bases de données Swissprot, Transfac et Genbank. Une approche de type macroarray permettra de sélectionner des gènes candidats: dans ce but, 288 ADNc pleine longueur dont 125 facteurs de transcription putatifs ont été déposés sur membrane. Le niveau d'expression de ces séquences dans le jeune xylème a été évalué dans des zones de bois avec ou sans fibres G. Les résultats préliminaires suggèrent que certains homologues de facteurs de transcription de type LIM, MYB, bHLH et Zn-Finger sont induits lors de la fornlation du bois de tension. L'implication de ces facteurs de transcription lors du processus de xylogenèse (division, expansion, mort cellulaire...) sera évaluée par l'utilisation de sondes prélevées à partir de cambium et de xylème mature provenant soit de bois tendu soit de bois opposé. Les résultats d'expression seront ensuite confirmés pour les gènes les plus intéressants par RT -PCR semi quantitative ou par Northem-Blot. La spécificité d'expression tissulaire des facteurs de transcription candidats sera approfondie en analysant leur expression au niveau des feuilles, racines et fleurs. L'ensemble de ces données d'expression nous donnera des pistes sur les possibles implications de ces facteurs de transcription dans le processus de formation du bois de tension. Le rôle dans la formation du bois des facteurs de transcription sélectionnés sera ensuite approché par d'autres techniques de génomique fonctionnelle telles que transgenèse, immuno-précipitation de chromatine et immunohistolocalisation.

Mots clés

Fichier non déposé

Dates et versions

hal-02764029 , version 1 (04-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02764029 , version 1
  • PRODINRA : 28880

Citer

Dominique Arnaud, Marie-Claude Lesage Descauses, Nadège Millet, Françoise F. Laurans, Annabelle Dejardin, et al.. Recherche de facteurs de transcription impliqués dans la différenciation des fibres G du bois de tension chez le peuplier. 8. Journées "Biologie Moléculaire des Ligneux", May 2004, Clermont-Ferrand, France. ⟨hal-02764029⟩

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