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Distribution spatiale et traduction fonctionnelle de la diversité microbienne des sols

Résumé : Le sol, après avoir longtemps été considéré comme un support de construction et de production, est maintenant légitimé comme un des derniers remparts pour la biodiversité terrestre. Parmi les organismes indigènes du sol, les microorganismes et notamment les bactéries sont les plus abondants et diversifiés avec plusieurs milliards d’individus représentant plusieurs millions d’espèces différentes par gramme de sol. De plus, ces microorganismes ont un rôle dans les cycles biogéochimiques des éléments majeurs (C, N, P…) et donc dans les services écosystèmiques que peut rendre le sol (recyclage éléments minéraux, qualité de l’atmosphère et de l’eau, production primaire…). Par conséquent, afin d’améliorer la qualité de notre environnement mais aussi la durabilité des modes d’usage des sols il est nécessaire de répondre à deux grandes questions relevant de la microbiologie environnementale : - qu’elle est la distribution spatiale et la régulation de la diversité des communautés microbiennes du sol à petite et grande échelle ? - qu’elle est la traduction des variations de la diversité microbienne des sols en fonctionnement biologique du sol et plus largement en services écosystémiques ? Dans cet exposé, nous présenterons les avancées scientifiques sur la distribution de la diversité microbienne obtenues par l’application des outils de séquençage haut débit à différentes échelles (nationale, régionale et paysage) d’une part, et le lien entre les différences de diversité observées à ces échelles et les mesures de fonctionnement biologique du sol d’autre part. La première approche nous permet de définir les règles d’assemblage des communautés microbiennes par une meilleure connaissance des filtres environnementaux structurant la distribution des populations la composant. La deuxième approche nous permet de conclure sur l’importance de la diversité microbienne dans les services écosystémiques que peut rendre le sol.
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https://hal.inrae.fr/hal-02806223
Contributor : Migration Prodinra Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Saturday, June 6, 2020 - 1:51:50 AM
Last modification on : Friday, May 20, 2022 - 9:06:21 AM

Identifiers

  • HAL Id : hal-02806223, version 1
  • PRODINRA : 265943

Citation

Sébastien Terrat, Samuel Dequiedt, Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Florentin Constancias, Vincent Tardy, et al.. Distribution spatiale et traduction fonctionnelle de la diversité microbienne des sols. Colloque de Génomique Environnementale Rennes 2013, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL). FRA., Nov 2013, Rennes, France. 1 p. ⟨hal-02806223⟩

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