Un procédé de fabrication de microorganismes lyophilisés,notamment de bactéries lyophilisées, du type où l'on procède durant l'une des étapes du procédé de fabrication à un ensemencement d'un milieu de culture avec une ou plusieurs souches de microorganismes, et se caractérisant en ce que l'on procède, avant l'étape d'ensemencement, au traitement du milieu de culture par un gaz de traitement comportant un gaz neutre ou un gaz réducteur ou un mélange de tels gaz neutres et réducteurs, pour obtenir une valeur du potentiel redox Eh du milieu déterminée, qui soit inférieure à la valeur obtenue quand le milieu est en équilibre avec l'air.