Gérer convenablement les puits de carbone pourrait permettre de compenser les émissions de CO2. Étant donné la superficie des terres arables, les pratiques sur les sols agricoles peuvent servir de levier d'action. Dans ce projet de thèse, nous faisons l’hypothèse que la séquestration du carbone est modifiée par le développement et la profondeur du système racinaire des cultures. À ce titre, les variétés de blé anciennes sont réputées pour leur système racinaire plus profond que celui des modernes. De plus, l’apport d’intrants chimiques de synthèse, dont les engrais azotés, pourrait modifier la dynamique du carbone du sol. Dans une étude de terrain, des variétés modernes et anciennes ont été cultivées avec ou sans intrants. La morphologie racinaire, les activités cataboliques potentielles et les émissions de CO2 de sol et racines incubés ont été mesurés pour estimer le stockage de carbone. Le génotype et les intrants considérés indépendamment n’ont pas impacté la biomasse, la surface et le diamètre moyen des racines. Toutefois, il existe un effet de l’interaction génotype*intrants : en absence d’intrants, les variétés anciennes présentaient une longueur racinaire plus importante que les modernes à la profondeur 0-15cm. En présence d’intrants, la longueur racinaire et le diamètre moyen des variétés modernes augmentaient. Les analyses MicroResp ont montré que la présence d’intrants entrainait une modification de la respiration pour le sol prélevé à 15-30cm. Les incubations avec suivi de CO2 sont en cours. Une expérience similaire a été mise en place sur trois autres sites pour tester la généricité des résultats.