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Identification of differentially expressed gene pathways between cytopathogenic and non-cytopathogenic BVDV-1 strains by analysis of the transcriptome of infected primary bovine cells

Abstract : Le virus de la diarrhée virale bovine 1 ( BVDV-1 ), appartenant au pestivirusgenre, est caractérisé par la présence de deux biotypes, cytopathogène (cp) ou non cytopathogène (ncp). Pour une meilleure compréhension des interactions hôte-pathogène, nous avons cherché à identifier des signatures transcriptomiques de cellules primaires pulmonaires bovines (BPC) infectées par une souche cp ou ncp. Pour cela, nous avons utilisé à la fois une approche ciblée par PCR numérique par gouttelettes de transcription inverse et une approche du génome entier utilisant RNAseq. L'analyse des données a montré 3571 transcrits exprimés de manière différentielle au fil du temps (Fold Change > 2) et a révélé que les voies les plus dérégulées pour la souche cp sont les voies de signalisation impliquées dans les réponses à l'infection virale telles que les voies de réponse inflammatoire ou d'apoptose. Fait intéressant, notre analyse des données a révélé une dérégulation de la voie de signalisation Wnt, une voie décrite dans l'embryogenèse,
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https://hal.inrae.fr/hal-03520542
Contributor : Sabine Rossi Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Tuesday, January 11, 2022 - 9:55:58 AM
Last modification on : Saturday, January 29, 2022 - 6:10:34 PM

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Rémi La Polla, Marie-Claire Testard, Abdelghafar Goumaidi, Elodie Chapot, Catherine Legras-Lachuer, et al.. Identification of differentially expressed gene pathways between cytopathogenic and non-cytopathogenic BVDV-1 strains by analysis of the transcriptome of infected primary bovine cells. Virology, Elsevier, 2022, 567, pp.34-46. ⟨10.1016/j.virol.2021.12.005⟩. ⟨hal-03520542⟩

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