Réponse transcriptionnelle de différents porte-greffes de vigne à l’inoculation par le champignon mycorhizien à arbuscules Rhizophagus irregularis
Résumé
La vigne (Vitis vinifera) est l'une des cultures arboricoles les plus importantes au monde. Cependant, la vigne est soumise à de multiples stress biotiques et abiotiques liés, entre autres, au changement climatique. La mycorhize à arbuscules, est une symbiose mutualiste entre la majorité des plantes terrestre (>80%) et certains champignons telluriques. Du fait de son système racinaire de faible densité et constitué de racines relativement épaisses, la vigne est une plante fortement dépendante de la symbiose mycorhizienne à arbuscule (SMA) pour sa croissance et son développement. Dans cette étude, nous avons conduit une étude transcriptomique par RNAseq pour analyser les effets de la colonisation par Rhizophagus irregularis sur le transcriptome des racines fines de 6 porte-greffes de vignes. La colonisation de la vigne par R. irregularis déclenche une forte reprogrammation du transcriptome de manière générale, impactant de nombreuses voies métaboliques comme le transport de nutriments et l’immunité végétale. Nous avons identifié environ 400 gènes régulés par la colonisation par R. irregularis, communs aux 6 porte greffes. Parmi ces gènes, 56 appartiennent aux systèmes de transport de la plante et 30 sont impliqués dans la signalisation. Cette étude souligne le fait qu’une partie de la régulation génique de la réponse à la mycorhization des différents porte-greffes de vigne ne provient pas d’un phénomène postérieur à leur obtention mais dérive probablement de caractères partagés par les lignées parentales