Relations entre diversité microbienne et contamination métallique dans des sols industriels
Abstract
Cette étude porte sur des sols forestiers entourant un site ayant une longue histoire industrielle métallurgique, effectuant actuellement le recyclage de batteries au plomb (Pb) et ayant eu par le passé une activité de seconde fusion du fer. L’objectif est de connaître les relations entre la contamination des sols en Pb et autres éléments-traces métalliques et les communautés microbiennes des sols. Des échantillons ont été prélevés dans trois types de sol et de couvert végétal (conifères et feuillus) et dans des zones de contamination métallique variable déterminées par mesures de fluorescence X in-situ (0-5 cm et 5-10 cm de profondeur). Des analyses pédologiques et géochimiques complémentaires ont été réalisées en laboratoire. La biomasse microbienne a été déterminée par extraction et quantification sur gel d’ADN total du sol. La diversité microbienne a été déterminée par extraction, amplification et séquençage de différentes régions codantes et non-codantes des gènes ribosomiques : une région de l’ADNr-16S (région V3-V4) pour la diversité des bactéries et une région inter-transcrits (ITS1) pour la diversité des champignons. Les résultats montrent une diversité microbienne importante, y compris dans les échantillons très contaminés, ainsi qu’une dépendance forte de certains groupes microbiens à la teneur en métaux, mais aussi au type de sol.