Prevalence of pretreatment HIV resistance to integrase inhibitors in West African and Southeast Asian countries
Avelin Aghokeng
(1)
,
Nicole Ngo-Giang-Huong
(1, 2)
,
Thu Huynh
(3)
,
Anoumou Dagnra
(4)
,
Thomas D’aquin Toni
(5)
,
Almoustapha Maiga
,
Kania Dramane
(6)
,
Sabrina Eymard-Duvernay
(7)
,
Marie-Laure Chaix
(8)
,
Vincent Calvez
(9, 10, 11)
,
Diane Descamps
(12)
,
Janin Nouhin
(13)
,
Coumba Touré Kane
(14)
,
Truong Xuan Lien
,
Martine Peeters
,
Jean-Christophe Plantier
,
Richard Njouom
,
Edouard Tuaillon
,
Thomas D’aquin Toni
,
Armel Poda
,
Jacques Zougrana
,
Saidou Ouedraogo
,
Macaire Ouedraogo
,
Eugene Messou
,
Jean Jacques Dechi
,
Jean François Nguessan
,
Oumar Dolo
,
Zoumana Diarra
,
Mamadou Cisse
,
Akouda Patassi
,
Mounérou Salou
,
Komla Ali-Edjé
,
Chureeratana Bowonwatanuwong
,
Suchart Thongpaen
,
Virat Klinbuayaem
,
Laddawan Laomanit
,
Que Anh Luong
,
Ton Tran
1
MIVEGEC -
Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle
2 CMU - Chiang Mai University
3 Institut Pasteur d'Ho Chi Minh Ville
4 Université de Lomé [Togo]
5 CIRBA - CENTRE INTÉGRÉ DE RECHERCHES BIOCLINIQUES D'ABIDJAN (CIRBA)
6 Centre Muraz [Bobo-Dioulasso, Burkina Faso]
7 UMR MoISA - Montpellier Interdisciplinary center on Sustainable Agri-food systems (Social and nutritional sciences)
8 AP-HP - Hopital Saint-Louis [AP-HP]
9 ICJ - Institut Camille Jordan
10 DRACULA - Modélisation multi-échelle des dynamiques cellulaires : application à l'hématopoïese
11 MMCS - Modélisation mathématique, calcul scientifique
12 IAME (UMR_S_1137 / U1137) - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution
13 Institut Pasteur du Cambodge
14 IRESSEF - Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation [Dakar, Sénégal]
2 CMU - Chiang Mai University
3 Institut Pasteur d'Ho Chi Minh Ville
4 Université de Lomé [Togo]
5 CIRBA - CENTRE INTÉGRÉ DE RECHERCHES BIOCLINIQUES D'ABIDJAN (CIRBA)
6 Centre Muraz [Bobo-Dioulasso, Burkina Faso]
7 UMR MoISA - Montpellier Interdisciplinary center on Sustainable Agri-food systems (Social and nutritional sciences)
8 AP-HP - Hopital Saint-Louis [AP-HP]
9 ICJ - Institut Camille Jordan
10 DRACULA - Modélisation multi-échelle des dynamiques cellulaires : application à l'hématopoïese
11 MMCS - Modélisation mathématique, calcul scientifique
12 IAME (UMR_S_1137 / U1137) - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution
13 Institut Pasteur du Cambodge
14 IRESSEF - Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation [Dakar, Sénégal]
Avelin Aghokeng
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- ORCID : 0000-0002-1414-0237
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Almoustapha Maiga
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Sabrina Eymard-Duvernay
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- IdHAL : seymardduvernay
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Marie-Laure Chaix
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- ORCID : 0000-0002-7798-4621
Vincent Calvez
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- IdHAL : vincent-calvez
- ORCID : 0000-0002-3674-1965
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Truong Xuan Lien
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Martine Peeters
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Jean-Christophe Plantier
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Richard Njouom
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Edouard Tuaillon
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Armel Poda
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Saidou Ouedraogo
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Macaire Ouedraogo
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Eugene Messou
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Jean Jacques Dechi
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Jean François Nguessan
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Oumar Dolo
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Zoumana Diarra
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Mamadou Cisse
- Fonction : Auteur
Akouda Patassi
- Fonction : Auteur
Mounérou Salou
- Fonction : Auteur
Komla Ali-Edjé
- Fonction : Auteur
Chureeratana Bowonwatanuwong
- Fonction : Auteur
Suchart Thongpaen
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Virat Klinbuayaem
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Laddawan Laomanit
- Fonction : Auteur
Que Anh Luong
- Fonction : Auteur
Ton Tran
- Fonction : Auteur
Résumé
Objectives:
Integrase strand transfer inhibitors (INSTIs) have been recently recommended as the preferred first-line option for antiretroviral treatment initiators in low- and middle-income countries (LMICs) in response to the growing circulation of resistant HIV to non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs). In this study, we estimated the frequency of pretreatment drug resistance (PDR) to INSTIs in West Africa and Southeast Asia.
Materials and methods:
Using samples collected from 2015 to 2016, and previously used to assessed PI, NRTI and NNRTI resistance, we generated HIV integrase sequences and identified relevant INSTI PDR mutations using the Stanford and ANRS algorithms.
Results:
We generated 353 integrase sequences. INSTI PDR frequency was low, 1.1% (4/353) overall, ranging from 0% to 6.3% according to country. However, frequency of PDR to any drug class was very high, 17.9% (95% CI: 13.9%–22.3%), and mostly associated with a high level of NNRTI PDR, 9.7%, and a moderate level of NRTI PDR, 5.3%.
Conclusions:
Our results support the recent introduction of INSTIs in LMICs to improve treatment outcome in these settings, but also stress the need for effective actions to prevent uncontrolled emergence of drug resistance to this drug class.