Introduction Les activités anthropiques (industrielles, urbaines, …) entrainent le rejet de nombreux contaminants chimiques dans les milieux aquatiques. Les substances émises sont nombreuses et en constante évolution, il faut donc mettre en place des stratégies de surveillance qui soient efficaces. Actuellement, celles-ci sont principalement basées sur l’analyse ciblée, qui s’intéresse à un nombre réduit de composés. De même, l’étude de nombreux contaminants dits « émergents » (CE) est relativement récente. De nouvelles approches d’étude telles que l’analyse non-ciblée sont ainsi en plein développement. L’objectif de cette étude est de coupler les approches ciblée et non-ciblée pour étudier la contamination organique (centrée sur les CE) en développant un workflow applicable aux eaux de surface. Le site sélectionné est la rivière Taragete qui traverse la ville minière d’Oruro en Bolivie et reçoit les eaux d’exhaure de la mine San José (acides et chargées en métaux lourds) ainsi que des eaux usées (EU) domestiques non traitées. Matériels et méthodes La rivière Taragete a été échantillonnée en amont de la ville et de la mine San José (site de référence, I), dans le canal acide en aval de la mine impacté également par les EU de la ville (C), et dans un canal urbain qui reçoit les EU d’Oruro mais qui ne présente pas d’impact avéré de la mine (H). Des échantillons de 500 mL d’eau ont été collectés (x5) sur chacun des trois sites en Octobre 2021. Après filtration et extraction sur phase solide, les CE sont analysés par chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse à haute résolution. Une approche d’analyse non-ciblée différentielle a été mise en œuvre, en complément à l’analyse ciblée de 33 CE, pour étudier les différences dans la contamination entre les sites contaminés. Résultats et discussion Les paramètres physico-chimiques (pH, conductivité, oxygène dissous, carbone organique dissous) et en métaux montrent que les activités minières et urbaines impactent différemment les sites C et H. L’analyse ciblée montre la présence de 16 CE quantifiés à des ordres de grandeur, dont l’acétaminophène et la cocaïne avec des concentrations de plusieurs µg.L-1. Cette étude a également confirmé que le site I peut être considéré comme site de référence : seuls deux marqueurs anthropiques (caféine et cotinine) y ont été quantifiés à concentrations inférieures à 20 ng/L. L’approche non-ciblée a permis d’identifier 14 CE au niveau 1 et 30 supplémentaires aux niveaux 2-4 (échelle de Schymanski). Les analyses statistiques et représentations graphiques (ACP, diagramme de Venn, vulcano plots) réalisées en analyse différentielle et criblage non-ciblé ont finalement permis d’illustrer et de confirmer les nombreuses différences entre les sites, en termes de contamination organique. Conclusions L’étude réalisée illustre la complémentarité entre analyse ciblée et non-ciblée pour obtenir une meilleure connaissance de la contamination en CE dans un contexte particulier de pollutions anthropiques multiples (urbaine, minière, …). Ce travail a aussi mis en évidence l’apport majeur de l’approche non-ciblée pour une caractérisation plus globale de la contamination environnementale et pour mettre en évidence des différences caractéristiques entre sites qui peuvent être occultées en analyse ciblée.