Cette thèse est une étude d'écologie descriptive et fonctionnelle des macrophytes du Scorff, rivière à salmonidés du Sud de la Bretagne. Dans la première partie, les milieux d'étude sont décrits, le plan d'échantillonnage précisé. La méthodologie employée, partiellement originale, est détaillée. Les macrophytes montrent une distribution longitudinale marquée qui peut être altérée par des ouvrages hydrauliques (retenues de moulin,...), et par des pollutions localisées (rejets de pisciculture,...). Des bioindicateurs ressortent comme Scapania undulata ou Callitriche obtusangula. La phytosociologie permet de distinguer 33 groupements de plantes vasculaires et 15 groupements bryophytiques dont la place symphytosociologique est discutée. Le suivi des recouvrements végétaux montre que les cycles sont moins marqués en zone ombragée qu'en milieu dégagé, en rivière qu'en ruisseau. Les stratégies d'occupation de l'espace de 5 macrophytes d'une part, la phénométrie de 2 espèces d'autre part, sont détaillées et les conséquences sur le fonctionnement des cours d'eau sont envisagées. La pollution d'une pisciculture ne se traduirait pas par un enrichissement en azote des macrophytes mais plutôt par une augmentation des populations nitrophiles ou polluo-résistantes. Les récoltes de biomasse en ruisseau sont en moyenne de 43 grammes de matière sèche par mètre carré de lit.