Développement de l'approche métabolomique par couplage chromatographie liquide / spectrométrie de masse : application à la nutrition - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Access content directly
Theses Year : 2010

Development of a metabolomic appraoch by mass spectrometry : application to nutrition

Développement de l'approche métabolomique par couplage chromatographie liquide / spectrométrie de masse : application à la nutrition

Abstract

The study of small molecules, defined as the metabolome, is an important analytical challenge due to the wide variety of metabolites with different physico-chemical properties, which are present at different concentrations. We report, here, an analytical strategy using mass spectrometry coupled to liquid chromatography (LC/MS) to acquire metabolic profiles from biofluids and identify potential biomarkers of metabolic dysfunctions. Special attention was given to the analytical variability from sample preparation to data processing. An optimized workflow was proposed and applied to a nutritional intervention (ANR METAPROFILE). The biomarker identification process included database queries and study of spectral informations from isotopic patterns to MSn fragmentations.
L'étude du métabolome est un challenge analytique important, de part la grande diversité chimique des métabolites présents à des concentrations très variables dans les matrices biologiques. Ce travail présente une stratégie analytique mettant en oeuvre le couplage chromatographie liquide / spectrométrie de masse afin d'acquérir des profils métaboliques de fluides biologiques et d'identifier des biomarqueurs potentiels de dysfonctionnements métaboliques. Une attention particulière a été donnée à l'étude des sources de variablité analytique, depuis l'étape de préparations d'échantillons jusqu'au traitement des données. Un protocole optimisé a été proposé et appliqué à une intervention nutrionnelle (ANR METAPROFILE). L'identification a été basée sur l'utilisation des bases de données, ainsi que sur l'interprétation des informations spectrales (profils isotopiques et fragmentations MSn)
Fichier principal
Vignette du fichier
2010CLF22013.pdf (3.04 Mo) Télécharger le fichier
Loading...

Dates and versions

tel-00719399 , version 1 (19-07-2012)

Identifiers

  • HAL Id : tel-00719399 , version 1
  • PRODINRA : 244815

Cite

Hélène Pereira. Développement de l'approche métabolomique par couplage chromatographie liquide / spectrométrie de masse : application à la nutrition. Alimentation et Nutrition. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2010. Français. ⟨NNT : 2010CLF22013⟩. ⟨tel-00719399⟩
444 View
2687 Download

Share

Gmail Facebook X LinkedIn More