A l'issue d'une première année de travail, nous avons avancé dans la plupart des tâches annoncées dans le projet initial. Chaque fois que cela a été possible, nous avons privilégié l'écriture d'une publication scientifique ; les textes produits, Cattanéo, Breil, Carrel et Lamouroux, sur l'hydrologie et les poissons du Rhône, Malavoi et Souchon sur une description révisée des faciès hydrodynamismes et Souchon, Albert, Andriamahéfa, Breil, Capra et Lamouroux sur le couplage physique et biologie (revue NSS) en sont au stade la relecture interne. L'idée générale était de fédérer au mieux les différentes unités, ce qui chacun le sait est souvent très consommateur en temps poru que les langages se rapprochent. Nous présentons ici sous une forme non toujours équilibrée entre parties les résultats et réflexions en cours, ainsi que les nouvelles propositions de protocole. Pour les thèmes biologiques, il s'agissait essentiellement d'établir un bilan de l'existant et de le rassembler sur une forme numérique facilement mobilisable lors des phases ultérieures. Les numéros des tâches renvoient au texte général de présentation de CAPHYR, leur formulation est rappelée en italique et les tâches qui ont donné lieu à un travail en 1999 sont mentionnées en caractères gras, les autres précédées de p.m.. Tout le travail de la thèse de H. Andriamahéfa, soutenue le 15 octobre 1999, n'est pas repris ici pour des raisons de volume (2 tomes). De même qu'un important matériel en cours de finalisation (mars 2000), qui concerne la régionalisation de l'habitat aquatique dans le bassin de la Loire (Souchon, Andriamahéfa, Cohen, Breil, Capra, Pella, Lamouroux, 2000).