Dans le cadre d'une étude sur des peuplements végétaux sur une dizaine de cours d'eau du Bassin Adour-Garonne, entre juin et septembre 1997, ont été réalisés des prélèvements d'algues filamenteuses. Les échantillons ont été prélevés sur 20 stations, où un développement significatif d'algues a été observé. Les algues rencontrées sur les stations des cours d'eau étudiés sont majoritairement regroupées en association de trois à sept taxons, avec une forte prédominance d'algues vertes et brunes : trois genres de chlorophytes, Spirogyra, Cladophora et Mougeotia et trois genres de chromophytes, Vaucheria, Melosira et Gomphonema. Dans l'ensemble les abondances sont variables, seuls les genres Cladophora, Zygnema et Vaucheria sont rencontrés avec des indices d'abondances peu variables et élevés, supérieurs à 4. La présence des genres Cladophora et Vaucheria dénote un certain état d'eutrophisation de tous les sites choisis dans cette étude, sauf la Vézère, et permet de prédire des risques de modifications des paramètres physico-chimiques des eaux (perturbation des cycles de l'oxygène et du pH). Sur une grande majorité des stations on observe la présence d'épiphytes, genres mono-cellulaires, fixés à d'autres algues, qui indiquent un état plutôt méso eutrophe à eutrophe. Par contre la faible part de cyanophycées dans les prélèvements rassure quant à l'état général de la qualité des eaux de ces cours d'eau.