Pour répondre aux demandes,de la Directive Cadre Européenne 2000/60/CE sur l'eau, les états membres doivent quantifier les relations existant entre la qualité biologique et les propriétés physiques et chimiques des eaux de surface. Un tel objectif nécessite la création, le développement et la validation de nouveaux outils d'évaluation de la qualité des écosystèmes aquatiques afin de pouvoir établir un diagnostic précis de l'état écologique des eaux de surface.Nous avons analysé les réponses de plusieurs métriques fonctionnelles décrivant la structure et l'organisation des communautés benthiques aux concentrations en micropolluants observées dans les sédiments benthiques, dans le but 1) de mieux décrire l'impact toxique sur Ies communautés in situ et 2) de sélectionner une combinaison de variables bio-écologiques capable de révéler l'impact des pressions toxiques sur l'écosystème.Le travail a été réalisé à une échelle nationale, sur des données faunistiques et chimiques issues des réseaux de mesures nationaux (RNB, RNDE).La sensibilité des variables biologiques et écologiques utilisées permet de définir les changements observés dans les communautés faunistiques en fonction de la nature des micropolluants présents dans les sédiments. Même si ces relations sont assez liées à la présence d'une contamination organique, nous sommes néanmoins en mesure de relier ces pressions toxiques à certaines réponses des communautés et donc d'envisager la prise en compte de nouvelles variables dans les méthodes d'évaluation de la qualité des cours d'eau.