Identification of European and Japanese larch and their interspecific hybrid with morphological markers: application to young seedlings - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement
Journal Articles Silvae Genetica Year : 2006

Identification of European and Japanese larch and their interspecific hybrid with morphological markers: application to young seedlings

Identification des mélèzes d'Europe et du Japon et de leur hybride à l'aide de marqueurs morphologiques : application à de jeunes semis

Abstract

Open-pollinated seed orchards of European and Japanese larch produce mixed progenies combining a highly variable proportion of hybrids along with pure parental species. For several reasons, it is desirable to identify and to sort out hybrids from the pure species at the seedling stage. Taxa identification of 1- to 2-year-old seedlings was attempted using non-destructive assessment of several traits, including morphology, phenology, growth and architecture parameters. Two sets of progenies originating from 10 hybridisation seed orchards were used, relying in a first step on taxa identification of individual seedlings with diagnostic molecular markers. Based on 21 traits assessed, some clear trends in pure species and hybrid features were apparent but due to the large and overlapping ranges of taxa characteristics, no single parameter allowed unambiguous identification of taxa. Combination of traits through linear discriminant analysis made possible correct classification of 90.2% up to 98.6 % of individuals depending on the orchard although there were a few problematic orchards. Two traits appeared particularly pertinent for discriminating young plant taxa, namely 1st-year leaf retention and the bark colour of 2nd-year shoot increments. Results were corroborated using progenies from several orchards and over two experimental periods.
Les vergers d'hybridation de mélèzes produisent des proportions très variables de graines hybrides mélangées à des graines de mélèze d'Europe et/ou du Japon. Afin de commercialiser des plants réellement hybrides, il serait souhaitable de pouvoir trier les hybrides des espèces pures en pépinière. Nous avons donc tenté d'identifier des plants de 1-2 ans à l'aide de critères morphologiques, phénologiques, de croissance et d'architecture et en utilisant des méthodes non destructives. L'étude a été réalisée à partir de deux jeux de descendances issues de dix vergers d'hybridation européens, chaque plant ayant été au préalable identifié grâce à des marqueurs moléculaires. Des différences sont apparues entre hybrides et espèces pures pour plusieurs des 21 caractères évalués mais, en raison de la forte variabilité des caractères étudiés, aucun d'entre eux n'a permis une identification suffisamment précise des taxons. En revanche, la combinaison de ces caractères dans des analyses linéaires discriminantes a abouti à une classification correcte de 90.2% à 98.6% des plants. Deux caractères sont apparus particulièrement pertinents pour différencier les taxons : la marcescence en fin de première année et la couleur de l'écorce des pousses de deuxième année. Ces résultats ont été validés sur le second jeu de descendances élevé dans des conditions différentes du premier.
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hal-02587894 , version 1 (16-07-2024)

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Cite

L.E. Pâques, Gwenaël Philippe, D. Prat. Identification of European and Japanese larch and their interspecific hybrid with morphological markers: application to young seedlings. Silvae Genetica, 2006, 55 (3), pp.123-134. ⟨hal-02587894⟩
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