Dans la continuité des inventaires biologiques réalisés sur quatre des bassins de la barrière hydraulique de Crépieux-Charmy au cours des années antérieures et à la suite des difficultés rencontrées en 2007, il est apparu nécessaire de poursuivre les investigations sur les cortèges algaux en présence afin de mieux en comprendre la dynamique. Le programme comportait la réalisation de deux assecs sur le bassin 2.2 et l'évaluation de leurs impacts sur les communautés végétales présentes. Le suivi a porté sur la physico-chimie des eaux des bassins et à la dynamique du développement des algues, algues macroscopiques et phytoplancton, au sein de 3 types de bassins et d'un pré-bassin au cours de 10 campagnes de mesures effectuées entre fin mai et fin septembre. Les évolutions des paramètres physico-chimiques sont similaires dans le pré-bassin 1 et les bassins 2.2, 5.2 et 6.2. Elles démontrent le lien direct entre ces bassins puisque l'eau les alimentant provient du pré-bassin 1 et d'autres pré-bassins tous alimentés par le Vieux-Rhône. Les eaux des bassins sont de qualité physico-chimique moyenne, basiques, bien minéralisées et bien oxygénées par les algues présentes. En termes de physico-chimie les pré-bassins jouent un rôle important dans le comportement des bassins qu'ils alimentent. Les teneurs en pigments chlorophylliens sont toujours faibles, inférieures à 12 µg/l et le bassin 2.2 s'avère le plus productif. Les communautés phytoplanctoniques rencontrées sont dans l'ensemble assez peu abondantes mais bien diversifiées avec au maximum 27 taxons. Les richesses taxinomiques et les répartitions au sein des groupes algaux sont très variables pour chacune des campagnes et chacun des bassins. Durant la période d'étude, ces communautés sont dominées par des diatomées et par quelques Cryptophycées. Les cyanobactéries sont très peu présentes, seulement de façon significative fin mai et mi-août. Les algues macroscopiques n'ont été observées que lors de 4 campagnes et sur 2 bassins et le pré-bassin. Elles sont principalement constituées de la cyanobactérie Phormidium sp. et d'une algue verte, Zygnema sp. Les impacts des mises en assecs sur le bassin 2.2 sont peu visibles. En effet, des difficultés de maintien en eau des autres bassins n'ont pas permis de réaliser de comparaison des dynamiques de développement des algues. D'une manière générale, les bassins de la barrière hydraulique sont très sensibles à la qualité physico-chimique et biologique des eaux du Vieux-Rhône ; par ailleurs, leur qualité est sous l'influence directe des pré-bassins d'alimentation. Au cours de l'étude de 2008, ils n'ont pas présenté de proliférations d'algues tant phytoplanctoniques que macroscopiques pouvant dégrader leur fonctionnement.