Les communautés de macrophytes sont des éléments de qualité biologique pertinents pour l'évaluation de la qualité écologique des lagunes méditerranéennes oligo et méso-halines au sens de la Directive Cadre Européenne sur l'Eau. Du point de vue de la salinité et des conséquences de ce paramètre sur leur fonctionnement, ces lagunes sont intermédiaires entre les lagunes saumâtres et les plans d'eau douce mais nécessitent une évaluation d'état écologique distincte des milieux strictement marins ou continentaux. Ce rapport présente les travaux préliminaires au développement d'un indicateur d'état écologique basé sur les communautés de macrophytes pour ces lagunes dites « dessalées ». Ces travaux ont principalement consistés en une participation à un comité de pilotage rassemblant l'Agence de l'Eau Rhône Méditerranée Corse, l'IFREMER, la station biologique de la Tour du Valat et le Cemagref et à l'élaboration d'une liste des taxons susceptibles d'être rencontrés sur ce type de milieux, puis en une proposition et un test d'un protocole d'échantillonnage adapté, et enfin en des premières réflexions sur le développement d'un indicateur d'état écologique.