Dans le cadre de la Directive Cadre sur l'Eau, un projet de recherche a été initié sur l'étude des diatomées benthiques des cours d'eau de l'île de La Réunion afin d'élaborer un indice de qualité des eaux. L'étude d'une cinquantaine de stations prélevées en novembre 2008 (première des cinq campagnes prévues), réparties sur les principales hydroécorégions de l'île ont permis d'appréhender la flore diatomique réunionnaise. Celle-ci se compose de taxons cosmopolites associés à des espèces tropicales. Des taxons non encore décrits appartenant aux genres Cymbopleura, Kobayasiella, Navicula et Achnanthidium ont été observés. L'illustration des principales espèces rencontrées (microscopie optique et électronique) ainsi que leur distribution géographique seront présentées.