L'efficacité de l'élimination de l'azote ammoniacal dans les procédés de traitement des eaux résiduaires urbaines et des effluents d’élevage peut chuter dans certaines conditions défavorables, notamment lors d'une baisse subite de la température de l’effluent, d'une augmentation brutale de la charge à traiter ou du passage d'un toxique. Les populations bactériennes nitrifiantes sont les premières à être impactées car elles sont très sensibles aux variations des différents facteurs environnementaux (pH, température, O2 dissous…). Elles ont de plus un taux de croissance très faible. Pour respecter la réglementation concernant les rejets azotés, il est possible de maintenir ou de restaurer la qualité du traitement de l'azote en ajoutant dans le bassin biologique des micro-organismes nitrifiants exogènes. Cette approche est appelée bioaugmentation. Nous nous limiterons dans cette présentation à la bioaugmentation bactérienne de l'activité nitrifiante des boues activées utilisant des solutions commerciales.