L'hydrogène sulfuré (H2S) est l'un des composés gazeux retrouvé dans le biogaz produit par les méthaniseurs agricoles. Il est très corrosif et engendre une dégradation prématurée des installations et particulièrement des co-génératrices. Un bonne gestion de l'alimentation en substrats et co-substrats permet de réduire ce risque.