Les espèces piscicoles présentes dans les rivières se répartissent différemment dans le temps et dans l’espace à plusieurs échelles spatiales (i.e. échelle locale, régionale ou continentale). Ces répartitions sont influencées notamment par l’habitat et les cycles de vie des individus. Afin de caractériser les variations des répartitions spatiales des poissons sur plusieurs dizaines de kilomètres, l’utilisation d’une nouvelle méthode d’Echantillonnage Ponctuel par Observation (EPO) en plongée est plus facile à mettre en place que la méthode d’Echantillonnage Ponctuel d’Abondance (EPA) par pêche électrique utilisée classiquement lors des suivis. Ce rapport présente les comparaisons des performances des EPAs et des EPOs à représenter les répartitions des espèces dans le linéaire de la rivière à partir d’analyses intégrant les variabilités temporelles des assemblages de poissons (i.e. entre les campagnes) mais également en intégrant les variabilités dans l’espace (i.e. entre les points d’échantillonnage et en intégrant les positions des points) pour des données obtenues à un jour d’intervalle en EPA et en EPO pendant cinq campagnes dans la rivière d’Ain (secteur =14 km) et pendant quatre campagnes dans le Seymard (secteur = 2.5 km). Les analyses mettent en évidence la présence de campagnes particulières ayant des assemblages de poissons différents des autres campagnes en EPO comme en EPA. Ces campagnes particulières ne sont pas les mêmes pour les deux méthodes. Ces analyses mettent également en évidence la présence de plusieurs points d’échantillonnage présentant des assemblages de poissons similaires en EPA et en EPO probablement en lien avec l’habitat. Enfin, ces analyses ont montré une plus grande similarité entre les représentations des répartitions spatiales des espèces lorsque les campagnes sont rassemblées. En conclusion, la méthode EPO peut être utilisée pour représenter les répartitions spatiales des espèces à condition d’effectuer des modifications du protocole (e.g. augmenter les réplicats temporels) mais également de les comparer non plus aux EPAs, qui ne peuvent plus être des référents, mais à des méthodes permettant de donner une vision exhaustive de la répartition de l’abondance de chaque espèce dans les secteurs étudiés (e.g. lors de pêches totales).