L'outil de comptage PHYTOBS permet le comptage du phytoplancton au microscope. Il est conforme à la norme Utermöhl (NF-EN 15204, 2006) relative au comptage du phytoplancton en microscopie inversée. De même il respecte le protocole standardisé d'échantillonnage du phytoplancton en plan d'eau dans le cadre de la DCE (Laplace-Treyture & al., 2009) et peut de ce fait servir aussi dans cet optique. Différentes options et fonctions permettent de synthétiser et d'exporter les résultats en vue de la bancarisation, de calculer des biovolumes. Un des boutons permet d'accéder à la liste taxinomique de référence des algues potentiellement rencontrées en France avec leur phylogénie et pour les noms considérés comme à jour la codification SANDRE. un nouveau module permet le calcul de l'indice Phytoplancton Lacustre (IPLAC).