L'échantillonnage passif représente une alternative aux prélèvements ponctuels pour la détermination de la contamination en pesticides. Les échantillonneurs présentent l'avantage d'intégrer la contamination du milieu pendant la période d'exposition de l'outil et permettent un abaissement des limites de détection grâce à l'accumulation des substances. Parmi les outils existants, les échantillonneurs passifs intégratifs pour les contaminants organiques polaires (POCIS : Polar Organic Chemical Integrative Samplers) ont été utilisés avec succès pour évaluer la contamination des hydrosystèmes en contexte agricole [1]. Ces POCIS peuvent être adaptés pour permettre la surveillance de milieux exigus ou de milieux à écoulements épisodiques tels que les fossés agricoles. Ces adaptations consistent à modifier les dimensions de l'outil, la surface membranaire, la quantité de phase ou encore la porosité des membranes pour influencer la quantité de substances accumulées [2]. Le projet de recherche multidisciplinaire PhytoCOTE étudie l'usage des pesticides dans les agrosystèmes, leurs transferts dans les écosystèmes connexes, leur bioaccumulation, et leur toxicité potentielle chez les organismes aquatiques. Le site d'étude est localisé dans une zone d'exploitation viticole sur la rive droite de l'estuaire de la Gironde. Dans ce cadre, un suivi annuel de la variabilité spatio-temporelle des concentrations en pesticides a été mis en place. Le suivi des cours d'eau permanents (ordre 1, 2 et 3) repose sur le déploiement de POCIS classiques à une fréquence mensuelle. Le suivi des fossés repose sur le déploiement de POCIS adaptés (miniPOCIS et POCIS-T) pendant la période d'application des pesticides. Parallèlement, des prélèvements d'eau sont réalisés à une fréquence mensuelle ou bimensuelle. Le suivi de la contamination est basé sur une liste de plus de 200 substances parmi lesquels les pesticides utilisés sur le bassin versant (54 substances). Différentes techniques d'extraction et d'analyse par LC-MS/MS et GC-MS/MS ont été développées pour permettre la quantification de ces composés.