Le suivi des plans d'eau français de plus de 50 hectares en accord avec la Directive Cadre Européenne sur l'eau a généré une base de données de phytoplancton incluant des abondances de diatomées. Le protocole d'échantillonnage consiste en un prélèvement intégré dans la zone euphotique, au point de plus grande profondeur du plan d'eau et à l'occasion de quatre campagnes annuelles suffisamment espacées dans le temps. Les abondances de diatomées ont été regroupées par genres à cause de nombreuses incertitudes sur les espèces et une étude statistique préliminaire des communautés de diatomées a été effectuée sur une base d'environ 200 plans d'eau, incluant des lacs naturels, des retenues et des plans d'eau artificiels. Les abondances des genres et des métriques de communautés ont été mises en relations avec 50 variables environnementales. Les résultats montrent les genres les plus communs, la forte saisonnalité des diatomées et révèlent des relations intéressantes avec des paramètres de qualité d'eau comme la concentration en nutriments.