Investigation methods to explore G protein-coupled receptor-regulated translatome
Méthodes d’étude du traductome régulé par les récepteurs couplés aux protéines G
Résumé
With the advent of next-generation sequencing technologies, identifying the translatome, which includes genome-wide ribosome-associated mRNAs, provides new opportunities to define faithfully the protein repertoire of a cell, as opposed to transcriptomic approaches. In addition, the role that extracellular signals such as hormonal modulations could play on the translatome remains to be deciphered. In particular, the regulation of the translatome by G protein-coupled receptors (GPCR) is still poorly described, albeit the trophic role that many receptors of this family play in their target cells. Here, we provide an overview of the current methods that are used to study the translatome, applied to the GPCR receptor family.
Depuis l’avènement des méthodes de séquençage à haut débit, l’identification du traductome, qui comprend l’ensemble des ARNm associés aux ribosomes, ouvre de nouvelles perspectives pour définir le répertoire des protéines réellement exprimées dans une cellule, contrairement au séquençage du transcriptome correspondant. De plus, l’impact que les signaux extracellulaires tels que des modulations hormonales peuvent avoir sur le traductome reste méconnu. En particulier, la régulation du traductome par les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) est un domaine encore peu exploré, alors que de nombreux récepteurs de cette famille jouent un rôle trophique très important dans leur cellule cible. L’objectif de cette revue est de présenter les méthodes les plus utilisées pour étudier le traductome, en les appliquant aux RCPG.