A new image of plantain diversity assessed by SSR, AFLP and MSAP markers
Une nouvelle image de diversité de plantain évaluée par des marqueurs de SSR, d'AFLP et de MSAP
Résumé
Using both SSR and AFLP markers, the genetic diversity of 30 plantains constituting a representative sample of the phenotypic diversity was assessed. The results confirmed a very narrow genetic base of this cultivar group. SSR and AFLP data support the hypothesis that these cultivars may have arisen from vegetative multiplication of a single seed. MSAP were used to survey cytosine methylation status at CCGG sites in order to obtain an alternative source of diversity data. A higher degree of polymorphism was revealed allowing the classification of the samples into three clusters. No correlation was observed between the phenotypic classification and methylation diversity. Implications for breeding programs are discussed.
En utilisant des marqueurs de SSR et d'AFLP, la diversité génétique de 30 plantains constituant un échantillon représentatif de la diversité phénotypique a été évaluée. Les résultats ont confirmé une base génétique très étroite de ce groupe de cultivar. Les données de SSR et d'AFLP soutiennent l'hypothèse que ces cultivars ont pu avoir résulté de la multiplication végétative d'une graine simple. MSAP ont été employés pour examiner le statut de méthylation de cytosine aux emplacements de CCGG afin d'obtenir une source alternative de données de diversité. Un degré plus élevé de polymorphisme a été indiqué en permettant la classification des échantillons dans trois faisceaux. On n'a observé aucune corrélation entre la classification et la diversité phénotypiques de méthylation. Des implications pour multiplier des programmes sont discutées