Comparison by molecular methods of Mycobacterium bovis strains isolated from bovine herds and wild animals
Comparaison des souches de Mycobacterium bovis isolées en France en élevage et dans la faune sauvage grâce aux techniques d’identification moléculaire
Résumé
Genotyping of Mycobactrium bovis strains, responsible of the tuberculosis in mammals, provides valuable information for studying dynamics of this zoonotic disease and better understanding its complexity. In France, the total collection of animal M. bovis strains, from wildlife and livestock, identified from 1978 to 2011, were genotyped by spoligotyping and VNTR typing. Fluctuations in genetic variability, depending on time and geographical localization, were observed with a decrease in the genetic diversity during the past 10 years. However, some strains which are widespread in the whole French territory tend to persist. Three of them, represent more than 50% of the global strains identified: SB0120, SB0134 and the F4-family. VNTR typing is very useful for highlighting their important genotypic diversity and strong regionalization of some strains. Besides, a better genotyping characterization had shown that the same type of strains can be identified both in wildlife and cattle. This observation proves the existence of multi-host M. bovis transmission systems. To conclude, molecular characterization tools in bovine tuberculosis have an important role to complete classical epidemiologic surveys. They permit to improve outbreak investigations, to implement new surveillance schemes, and to evaluate the efficacy of national control programs.
Le génotypage de souches de Mycobacterium bovis, la bactérie responsable de la tuberculose chez les mammifères, apporte des données précieuses en permettant d’étudier la dynamique de cette zoonose et de mieux comprendre sa nature complexe. Les génotypes de la collection complète de souches, provenant d’animaux sauvages et de rente, de M. bovis françaises, répertoriées de 1978 à 2011, ont été obtenus par spoligoypage et typage VNTR. Des fluctuations dans la variabilité génétique du bacille au cours du temps et en fonction de la zone géographique étudiée ont été constatées, avec une diminution de la diversité génétique des souches ces dix dernières années. Cependant certaines souches persistent au cours du temps et sont réparties sur l’ensemble du territoire. Trois types de souches représentent plus de 50 % de la totalité des M. bovis françaises : SB0120, SB0134 et la famille F4. Leur typage VNTR permet de mettre en lumière leur grande diversité et la forte régionalisation de certains types. Par ailleurs, la connaissance approfondie du génotype a permis d’identifier des souches régionalisées infectant de manière indifférenciée aussi bien la faune sauvage que les animaux de rente. Ce constat prouve la capacité des souches à proliférer au sein d’un système multi-hôtes. En conclusion, les outils de caractérisation moléculaire de la tuberculose bovine sont d’une très grande utilité pour compléter les approches épidémiologiques conventionnelles. Ils permettent d’améliorer le suivi des foyers, d’orienter la mise en place de nouveaux schémas de surveillance mais également d’évaluer l’efficacité des programmes de contrôle.