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Conference papers

MEETAC - Valorisation des données transcriptomiques bovines à l’interface mère-embryon pour une compréhension intégrée de l’implantation

Résumé : Parmi les différentes composantes qui contribuent à la fertilité -de la production des gamètes à la parturition-, les interactions entre le conceptus et l'utérus au cours de la période péri-implantatoire représentent une étape clef dont le déroulement conditionne l'issue de la gestation. Chez les vaches laitières hautes productrices, il est également établi que les pertes embryonnaires péri-implantatoires représentent plus de 40% des échecs de gestation. Cette mortalité embryonnaire contribue à la baisse de fertilité observée au sein des élevages bovins laitiers, avec des conséquences économiques importantes pour la filière. Chez les ruminants, le premier mois de gestation est associé à un important changement de taille du conceptus (élongation) au sein duquel se mettent en place les différenciations cellulaires essentielles pour le développement de l'unité foeto-placentaire. La période péri-implantatoire correspond également à la phase de reconnaissance maternelle de la gestation, au cours de laquelle (i) l'endomètre préparé par les stéroides ovariens réagit à une grande variété de signaux moléculaires produits par le conceptus (ii) les signaux d'origine utérine vont exercer un contrôle sur le développement du conceptus (Sandra et al. 2011 ; 2012). Au cours de la dernière décennie, les analyses transcriptomiques menées sur les versants endométrial et embryonnaire (souris, humain, mammifères d'élevage) ont permis de préciser la physiologie utérine ou le développement embryonnaire que ce soit en conditions physiologiques ou pathologiques. Le programme MEETAC propose une vision intégrée des profils de gènes exprimés par l'utérus et l'embryon au cours de la période péri-implantatoire chez le bovin. De telles analyses n'ont pas été encore publiées ce qui confère à ce projet un authentique défi qui lie l'expression du gène à la réalité de l'élevage au travers des tâches suivantes: L'analyse extensive des données haut-débit disponibles dans la littérature et générées à partir du tissu extra-embryonnaire et d'endomètre bovins. L'annotation précise des réseaux bovins disponibles -incluant le contexte génomique tels que les promoteurs ; les domaines et motifs protéiques des cadres de lecture ouverts- et la production d'outils biostatistiques/bioinformatiques dédiés afin de créer une base de données ouverte au plus grand nombre. L'identification in silico et la validation biologique des interactions entre facteurs de transcription et leurs séquences cibles dans les promoteurs définis à partir des données de transcriptomique disponibles à l'interface endomètre-conceptus chez le bovin. L'identification de biomarqueurs non-invasifs permettant de diagnostiquer la gestation précoce et d'en prédire l'issue.
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https://hal.inrae.fr/hal-02747630
Contributor : Migration Prodinra <>
Submitted on : Wednesday, June 3, 2020 - 12:09:30 PM
Last modification on : Monday, April 26, 2021 - 2:24:15 PM

Identifiers

  • HAL Id : hal-02747630, version 1
  • PRODINRA : 269133

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Citation

Olivier Sandra, Christophe Klopp, Jean-François Gibrat, Claire Ponsart, Maria-Céleste Le Bourhis. MEETAC - Valorisation des données transcriptomiques bovines à l’interface mère-embryon pour une compréhension intégrée de l’implantation. 9. Colloque Agenae / ANR, Colloque Génomique Animale et Microbienne, AGENAE - Analyse du Génome des Animaux d'Elevage (AGENAE). FRA., Mar 2012, La Rochelle, France. pp.90. ⟨hal-02747630⟩

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